作为一个使用5年AE和3年NUKE的萌新来讲，对我来说AE和nuke不存在本质上的谁更好用的问题。相对的，他们都有相对侧重的地方。
大多数人可能都会说AE适合栏包，NUKE适合电影。但这样讲太宽泛，比如AE＋C4D就完成了攻壳机动队 里面的大量Mattepainting场景。而NUKE也会经常被用于大型商业广告的抠像，擦除，合成等工作。所以他们在领域方面并没有非常严格的分界。
所以对于这个问题只能说某些功能或者效果对于其中的一个软件更为好用。
举几个例子，比如nuke内置keylight, ibk, primatte, keyer等专业的抠像工具，每种抠像工具对不同类型的镜头又有不同的倾向性，这可以让NUKE独立完成复杂的抠像镜头，并且清晰的节点树可以保证让你在保留细节的同时让自己的工程十分整洁，最高效率的完成镜头的制作(这里也不得不提NUKE的roto比AE的mask要好用太多) 。另外，像对于EXR序列文件的处理，NUKE无论是流程上还是速度上都相对AE有压倒性的优势。此外NUKE还具备真三维合成，深度合成，立体合成等等高级合成能力。最重要的是NUKE有严格的色彩空间管理系统，同时还支持OCIO和ACES色彩工作方式，作为线性工作流的软件十分出色。
相对的，AE的灵活性很高，可扩展性非常强。他有非常多的插件可以使用(越多的插件会使软件越卡)，这就可以非常快的制作一些简单的特效。比如各种粒子效果，伪三维特效，光效等等。另外有了AK大神、REE GAINT等大咖的加持，AE还可以很好的完成一些简单的三维效果。现在的E3D和ORB也都支持GPU加速和 PBR材质流程，所以可以非常快的完成炫酷的效果和产品展示等等。不久的未来，AK大神还会发布一个可以直接读取VDB的插件Nebula，可以制作非常好的Volume light。另外最特别的就是MG动画的领域，我相信没有人会用NUKE去做的。
但是使用层级工作流就注定限制了他的工作规模。他并不适合大型项目的团队协作。所以如果你单兵作战去做一些小型项目，AE会是不错的选择~
总之这两款软件各有各的优势，我也非常喜欢这两款软件，并且这两款软件可以说在合适的情况下，都非常好用！
纯手机码的，希望对你有帮助[耶]
